开年第一爆火热点——双硫死亡，8种生信分析切入思路超级大 ...

鞍山捂眼祖

2023年开年就来了个超级大热点——双硫死亡，与去年3月提出的铜死亡的爆火程度不相上下


遵循铁死亡、铜死亡的发展规律，新方向刚一爆出，第一波发文肯定是生信分析（ps：为什么呢？那必须得提一下生信分析的大优势——发文周期短，低投入高回报），我们现在要做的就是眼疾手快抓住热点红利期，以最小投入抢发高分生信文章！！
那“双硫死亡”要做生信具体怎么切入呢？其实“双硫死亡”完全可以按铜死亡的套路走，小云整理了8种可做的思路一次性送给朋友们，新热点红利期千万不要错过，想第一波吃螃蟹的生信人抓紧上车啦！！

初级版思路
1
双硫死亡关键基因的单基因分析或单基因泛癌分析
选取 “双硫死亡”的关键基因进行单基因分析或单基因泛癌分析，单基因分析是最基础也是最好上手的分析思路，可以先以单基因分析快速发个简单的生信文章，后续还可以利用生信分析结果进行延伸、加上实验研究形成大课题：



题目：透明细胞肾细胞癌中关键铜死亡调节因子FDX1的预后、临床病理和功能研究



题目：泛癌整合生物信息学分析揭示铜下垂相关基因FDX1是低级别胶质瘤的潜在预后和免疫治疗生物标志物

2
肿瘤预后模型构建思路
利用Nature文章中影响“双硫死亡”的关键基因作为基因集，进行预后模型构建和后续分析：



题目：头颈部鳞状细胞癌中一种新铜死亡相关基因特征的鉴定

3
肿瘤分型分析、分型+预后模型构建思路
基于“双硫死亡”基因集中的基因表达模型，进行疾病分型分析，出于临床应用性一般在肿瘤分型分析后还会构建预后模型和简单分析：



题目：胃癌中铜死亡相关亚型的鉴定、预后模型的构建和肿瘤微环境景观分析

4
非编码RNA思路
利用“双硫死亡”基因集中的基因筛选双硫死亡相关lncRNA，建立lncRNA预后模型或根据lncRNA表达进行肿瘤分型分析+预后模型构建：



题目：基于铜死亡相关LncRNA预测乳头状肾细胞癌的预后和免疫治疗反应



题目：铜死亡相关lncRNA:透明细胞肾细胞癌的预后预测和亚型鉴定

5
非肿瘤疾病中“双硫死亡”思路
利用“双硫死亡”基因集筛选疾病生物标志物、进行诊断模型的构建以及进行疾病分型分析：



题目：阿尔茨海默病铜死亡相关分子簇的鉴定及免疫学特征分析



题目：克罗恩病免疫浸润和铜死亡相关亚群的鉴定

进阶版思路
6
肿瘤预后模型构建/分型分析+单细胞数据分析
在常规的肿瘤预后模型构建、肿瘤分型分析或模型构建+分型分析思路的基础上，添加一些单细胞数据分析（ps：一般会利用单细胞数据做一些免疫相关分析，更简单一点也可以利用肿瘤微环境相关单细胞数据库TISCH分析，无需二次分析单细胞数据，数据库在线工具可以直接出图），大大地提高创新性：



题目：铜死亡描述了肿瘤微环境表型并预测膀胱癌的精准免疫治疗和预后

7
多热点联合分析思路
将“双硫死亡”与其他细胞死亡方向或细胞死亡外的生信热点联合分析，比如与铜死亡、铁死亡联合，与m6A结合等等：



题目：一种基于铜死亡相关RNA甲基化调节因子的新风险模型的鉴定和发展，用于预测肝细胞癌的预后和表征免疫状态



题目：铜死亡和铁死亡调节因子之间的相互作用定义了肿瘤微环境，以预测肺腺癌预后和治疗

8
干湿结合思路多热点联合分析思路
在肿瘤预后模型构建/肿瘤分型分析或单基因分析等纯生信分析的基础上，添加一些关键基因的验证实验，最简单常用的是表达验证（临床样本、细胞样本中进行qPCR、WB或IHC实验），进一步就是基因表达验证（一般在细胞中进行过表达或敲除，检测细胞功能，有些会做到动物模型）。干湿结合是生信分析的发展趋势，并且这个趋势已经到来，所以在“双硫死亡”中尽早加上验证实验也是一种比较有竞争力，容易拿高分的思路：



题目：肝细胞癌中铜死亡相关lncRNAs的综合分析及其预后意义和免疫微环境特征